MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 9129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002662	T	6	6	110	115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002662	AAT	2	6	130	135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002662	T	7	7	149	155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002662	T	7	7	194	200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002662	TAA	2	6	242	247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002662	TGG	2	6	258	263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002662	CTTT	2	8	268	275	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_002662	CAA	2	6	331	336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_002662	CTA	3	9	1833	1841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_002662	TAT	2	6	1846	1851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002662	TGTC	2	8	3069	3076	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_002662	T	6	6	3124	3129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002662	GATA	2	8	10062	10069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002662	TTAAAT	2	12	10847	10858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002662	GGT	2	6	10924	10929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002662	TGA	2	6	10975	10980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002662	TAAT	2	8	11088	11095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002662	AAATG	2	10	12242	12251	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002662	GAA	2	6	12302	12307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002662	A	6	6	12309	12314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002662	AAGG	2	8	12334	12341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002662	T	7	7	12695	12701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002662	ATTG	2	8	12716	12723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002662	TAC	2	6	12726	12731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_002662	TAA	2	6	12752	12757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002662	ACAA	2	8	12787	12794	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_002662	TTAA	2	8	12796	12803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002662	AAAG	2	8	12819	12826	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002662	CAAA	2	8	12829	12836	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_002662	A	7	7	12859	12865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002662	TAGC	2	8	12890	12897	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_002662	TTA	2	6	12898	12903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002662	AGG	2	6	12912	12917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002662	T	8	8	15958	15965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002662	CTC	2	6	15967	15972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_002662	TAAA	2	8	15977	15984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002662	TAA	2	6	15992	15997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002662	AGA	2	6	16581	16586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002662	A	8	8	20660	20667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002662	TA	3	6	20690	20695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002662	A	6	6	20703	20708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002662	TAA	2	6	20716	20721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002662	A	6	6	20734	20739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002662	A	6	6	20749	20754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002662	A	7	7	21282	21288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002662	TAA	2	6	21313	21318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002662	ATG	2	6	21332	21337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002662	ATC	2	6	21671	21676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_002662	A	6	6	22407	22412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002662	TAT	2	6	22413	22418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002662	T	6	6	22423	22428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002662	CTATT	2	10	22435	22444	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_002662	ACA	2	6	22501	22506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_002662	ATT	2	6	22510	22515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002662	ATGGA	2	10	22518	22527	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002662	A	6	6	25727	25732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002662	TACT	2	8	25744	25751	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_002662	TTA	2	6	25816	25821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002662	AAG	2	6	25833	25838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002662	TAA	3	9	25856	25864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002662	T	9	9	27986	27994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002662	A	6	6	28030	28035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002662	GAC	2	6	28071	28076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_002662	TTA	2	6	28085	28090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002662	ATT	2	6	28103	28108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002662	A	7	7	28138	28144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002662	ATA	2	6	28156	28161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002662	CAA	2	6	28185	28190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_002662	CGG	2	6	28233	28238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_002662	GGA	2	6	28273	28278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002662	GCGT	2	8	28332	28339	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_002662	TCC	2	6	28356	28361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_002662	AGC	2	6	28383	28388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_002662	TCG	2	6	28397	28402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_002662	CGG	2	6	28498	28503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_002662	CTTAA	2	10	28604	28613	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_002662	TATT	2	8	28701	28708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002662	AAGTC	2	10	28745	28754	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_002662	GTA	2	6	28836	28841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002662	ATG	2	6	28859	28864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002662	T	7	7	28915	28921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002662	ATC	2	6	28933	28938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_002662	TTTA	2	8	28973	28980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002662	G	6	6	29135	29140	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002662	TTC	2	6	29152	29157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_002662	TAA	2	6	29178	29183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002662	GCA	2	6	29191	29196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_002662	TGCT	2	8	29210	29217	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_002662	TGG	2	6	29247	29252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002662	A	6	6	29253	29258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002662	GGA	2	6	29275	29280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002662	TGGT	2	8	29282	29289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002662	ATT	2	6	29311	29316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002662	AGG	2	6	29337	29342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002662	TAA	2	6	29411	29416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002662	A	7	7	29415	29421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002662	TGA	2	6	29424	29429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002662	TAA	2	6	29472	29477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002662	ATT	2	6	29639	29644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002662	CAAT	2	8	29656	29663	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_002662	GGT	2	6	29838	29843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002662	ATG	2	6	29871	29876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002662	T	6	6	29889	29894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002662	AAT	2	6	29931	29936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002662	ATT	2	6	29979	29984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002662	GGT	2	6	30018	30023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002662	GCA	2	6	30063	30068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_002662	TTTTA	2	10	30092	30101	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002662	TGAT	2	8	30118	30125	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002662	AAT	2	6	30201	30206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002662	TCA	2	6	30273	30278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_002662	TTG	2	6	30382	30387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002662	ATG	2	6	30478	30483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002662	AGT	2	6	30492	30497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002662	ACT	2	6	30504	30509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_002662	AAT	2	6	30530	30535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002662	TGA	2	6	30581	30586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002662	ATG	2	6	30601	30606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002662	CAA	2	6	30745	30750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_002662	A	6	6	30770	30775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002662	TTG	2	6	30802	30807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002662	ATTA	2	8	30812	30819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002662	AAATA	2	10	30858	30867	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002662	A	6	6	30907	30912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002662	A	6	6	33341	33346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002662	T	6	6	33367	33372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002662	TA	3	6	33409	33414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002662	TAAA	2	8	33453	33460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002662	AGTA	2	8	33466	33473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002662	GAT	3	9	34645	34653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002662	T	6	6	34653	34658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002662	A	8	8	34701	34708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002662	TTA	2	6	34720	34725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002662	TA	3	6	34724	34729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002662	T	7	7	34767	34773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002662	CGAA	2	8	34831	34838	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_002662	T	7	7	34927	34933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002662	CAG	2	6	34940	34945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_002662	AAG	2	6	34961	34966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002662	CCA	2	6	35000	35005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_002662	TAA	2	6	35032	35037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002662	TAA	2	6	35044	35049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002662	A	7	7	35048	35054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002662	T	6	6	35102	35107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002662	T	6	6	35118	35123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002662	TAA	2	6	35133	35138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002662	AT	3	6	35193	35198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002662	T	7	7	35198	35204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002662	AT	4	8	35205	35212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_002662	T	7	7	35252	35258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_002662	C	6	6	35298	35303	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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446	NC_002662	TTTA	2	8	92820	92827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_002662	TCC	2	6	92850	92855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
448	NC_002662	TGAG	2	8	92905	92912	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
449	NC_002662	TCA	2	6	92916	92921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_002662	CTATA	2	10	92937	92946	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
451	NC_002662	ACT	2	6	92947	92952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_002662	TATT	2	8	93023	93030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_002662	CTT	2	6	93138	93143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_002662	AGA	2	6	93668	93673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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463	NC_002662	GATG	2	8	93767	93774	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
464	NC_002662	GCA	2	6	93875	93880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
465	NC_002662	AATA	2	8	94202	94209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_002662	TTA	2	6	94755	94760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_002662	ATTCT	2	10	94779	94788	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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472	NC_002662	CAT	2	6	95219	95224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
473	NC_002662	TTA	2	6	95236	95241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_002662	TCC	3	9	95247	95255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
475	NC_002662	TCA	2	6	95275	95280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
476	NC_002662	ATA	2	6	95311	95316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_002662	CCTA	2	8	95427	95434	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
481	NC_002662	CTATA	2	10	95436	95445	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
482	NC_002662	GATA	2	8	95469	95476	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
483	NC_002662	TA	3	6	95475	95480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_002662	TTG	2	6	95513	95518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
485	NC_002662	T	6	6	95526	95531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_002662	TTC	2	6	95565	95570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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489	NC_002662	A	6	6	95678	95683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_002662	A	6	6	95706	95711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_002662	T	6	6	95822	95827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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494	NC_002662	TTA	2	6	96287	96292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
495	NC_002662	GTAAA	2	10	96325	96334	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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